Bonsaide kazık kök mutlaka kesilir. Bununla birlikte bir miktar saçak kök te kesilir. Yoksa bitki saksıya sığmaz. Ayrıca kök budaması ağacın büyümesini yavaşlatır. Bizim istediğimizde budur. Kök budamasının bir sebebi de bitkinin daha sağlıklı gelişimi içindir. Sadece bonsaide değil, bahçeye dikeceğiniz saksılı **** tüplü bir fidanında kök budamasına ihtiyacı vardır. Fakat bahçeye dikeceğinizin kazık kökünü kesmiyorsunuz
Meyvecilikte buna kök tuvaleti deniyor.